Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
VAMP1P23763 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms