Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RAB5AP20339 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RAB5AP20339 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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