Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
AMY2BP19961 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms