Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATF3P18847 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATF3P18847 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms