Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTPRAP18433 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTPRAP18433 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
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