Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GLI3P10071 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GLI3P10071 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms