Protein–RNA interactions for Protein: P0DP91

CSB-PGBD3, Chimeric ERCC6-PGBD3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSB-PGBD3P0DP91 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CSB-PGBD3P0DP91 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CSB-PGBD3P0DP91 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms