Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEFMP07197 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEFMP07197 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFMP07197 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEFMP07197 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEFMP07197 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEFMP07197 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEFMP07197 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms