Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
VAMP4O75379 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
VAMP4O75379 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms