Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ATP10AO60312 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP10AO60312 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms