Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
PDE6DO43924 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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PDE6DO43924 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PDE6DO43924 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PDE6DO43924 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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