Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HTRA2O43464 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HTRA2O43464 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms