Protein–RNA interactions for Protein: A6PVI3

NCBP2L, Nuclear cap-binding protein subunit 2-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP2LA6PVI3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NCBP2LA6PVI3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms