Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HECTD4Q9Y4D8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
HECTD4Q9Y4D8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms