Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U8

LEMD3, Inner nuclear membrane protein Man1, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LEMD3Q9Y2U8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LEMD3Q9Y2U8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms