Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TRAPPC4Q9Y296 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRAPPC4Q9Y296 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms