Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SHANK2Q9UPX8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.83■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SHANK2Q9UPX8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms