Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TTF2Q9UNY4 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TTF2Q9UNY4 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms