Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CHIC2Q9UKJ5 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CHIC2Q9UKJ5 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms