Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GGA1Q9UJY5 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GGA1Q9UJY5 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms