Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
MED13Q9UHV7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms