Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
IFT172Q9UG01 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IFT172Q9UG01 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms