Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
KLHL42Q9P2K6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms