Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP35Q9P2H5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP35Q9P2H5 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
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