Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SCHIP1Q9P0W5 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SCHIP1Q9P0W5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms