Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
KCMF1Q9P0J7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms