Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU7

CABP1, Calcium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP1Q9NZU7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CABP1Q9NZU7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CABP1Q9NZU7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms