Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
EHD3Q9NZN3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
EHD3Q9NZN3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms