Protein–RNA interactions for Protein: Q9H1E5

TMX4, Thioredoxin-related transmembrane protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4Q9H1E5 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TMX4Q9H1E5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms