Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
CTDSP1Q9GZU7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP1Q9GZU7 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP1Q9GZU7 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP1Q9GZU7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP1Q9GZU7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
CTDSP1Q9GZU7 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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