Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
KLHL4Q9C0H6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KLHL4Q9C0H6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms