Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CIPCQ9C0C6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CIPCQ9C0C6 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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