Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXQ1Q9C009 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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FOXQ1Q9C009 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXQ1Q9C009 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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