Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NMES1Q9C002 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms