Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NLRP1Q9C000 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NLRP1Q9C000 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms