Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
THUMPD2Q9BTF0 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
THUMPD2Q9BTF0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms