Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
FYCO1Q9BQS8 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FYCO1Q9BQS8 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms