Protein–RNA interactions for Protein: Q99962

SH3GL2, Endophilin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL2Q99962 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SH3GL2Q99962 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms