Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMAD5Q99717 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SMAD5Q99717 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms