Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PSMD1Q99460 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PSMD1Q99460 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms