Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CRAMP1Q96RY5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CRAMP1Q96RY5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms