Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CITED4Q96RK1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms