Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRAM1Q96QH2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAM1Q96QH2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms