Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ALS2Q96Q42 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ALS2Q96Q42 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms