Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMG1Q96Q15 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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