Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM227BQ96M60 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM227BQ96M60 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms