Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN8

NEURL4, Neuralized-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL4Q96JN8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
NEURL4Q96JN8 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NEURL4Q96JN8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms