Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC9

EAF1, ELL-associated factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EAF1Q96JC9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EAF1Q96JC9 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms