Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATG4CQ96DT6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG4CQ96DT6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms