Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC9

OTUB2, Ubiquitin thioesterase OTUB2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUB2Q96DC9 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OTUB2Q96DC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms